Vou apenas resumir alguns pontos desse artigo e acrescentar outros, no total 15:

1. Animação; Ambas as tecnologias usam uma timeline, embora no flash seja apenas usada animação frame-by-frame, no silverlight pode ser usada uma animação baseada em tempo, definindo o estado de um elemento no inicio e o mesmo estado no final sendo a animação feita percorrendo essa linha de tempo mas também pode ser usada a animação frame-by-frame usando o Blend. O flash implementa alguns novos tipos de animações na sua ultima versão.
2. Tamanho final; O flash disponibiliza a sua versão final comprimida, podendo embutir ficheiros, video e audio, enquanto que o silverlight usa o XAML como descritor da aplicação e como não usa qualquer compressão, geralmente o tamanho das suas aplicações é bem maior.
3. Programação; O flash/flex utiliza o Action Script  que é conhecido pela sua grande versatibilidade, possui uma extensa lista de recursos disponiveis na web, muitos componentes feitos e a capacidade de comunicar praticamente com qualquer outra linguagem, como php, asp, ruby, java e muitas mais. Existem algumas IDE’s para programação de Action script gratuitas e a própria framework Flex é gratuita e open source. 
   O silverlight utiliza como sua base de linguagem o Visual C .net ou visual basic .net. Está reduzido ao uso dos produtos da microsoft, quem não são open source embora já exista uma ou outra alternativa gratuita para servidor de IDE. O suporte do .NET já é grande, mas não têm comparação ao flash/flex. Como se trata de uma tecnologia recente, ainda se encontra  limitado no que diz respeito à comunicação com outras linguagens de programação embora também seja possivel. Uma das vantagens neste aspecto é a vantagem profissional, para desenvolver silverlight existem profissionais com cursos superiores e formação em .NET, enquanto que o action script não é profissionalizado o suficiente para merecer o titulo de profissional principalmente no que diz respeito ao Adobe Flex.
4. Video e Audio; O Flash suporta enumeros formatos de video e audio, que se juntarmos ao Flash Media Server transforma o flash capaz de ler grande parte dos formatos do mercado incluindo video em alta definição com codec’s como H.263 ou H.264. Enquanto que o silverlight ainda se encontra limitado ao Windows Media Video/Audio; wmv ou wma. O flash suporta renderização 3d (nativa no flash 10.x) enquanto que no silverlight o suporte é muito reduzido ou quase nulo. (espera-se que melhore na versão 3)
5. Processamento de som; O Flash pode até gerar som nas versões 10.x do flash player. Nativamente já possui bastantes classes para lidar com audio, em especial mp3. O Silverlight não possui qualquer API nativa de controlo de Audio, nem mesmo para para o playback de ficheiros WAV.
6. Acessibilidade; Ambas as tecnologias possuiem algum suporte, o silverlight consegue mesmo interpretar alguns comandos nativos do sistema operativo para tornar o conteudo mais acessivel, mas nada que se compara ao flash. O Flash/Flex alem de controlo visual, permite a atribuição de por exemplo, indexação de controlos, para a acessibilidade via teclado. Permite apresentar nativamente “legendas” e comentarios sobre um playback de arquivos de video, e um amplo controlo de funçoes por parte do utilizador como o controlo do audio com o teclado numérico.
7. Compatibilidade; O flash é compativel com a maioria dos Sistemas Operativos do mercado, incluindo as versões do Windows, Mac, Linux (openSUSE e Ubuntu…) e Solaris. 
   O silverlight é compativel com Windows, incluindo o mobile, mac e algumas distribuições linux com recurso ao moonlight. 
8. SEO – Search Engine Optimization; Aqui o flash ainda está a dar os primeiros passos, sendo que apenas o google anunciou o suporte à indexação de conteudo flash (já é um passo importante) e a yahoo pretende seguir os passos do google. Neste aspecto o MSN está a desenvolver a mesma tecnologia para silverlight. Como o silverlight compila o texto em arquivos separados, este texto pode ser lido como tal e é facilmente indexado nos motores de busca.
9. Formatos de imagem; Neste aspecto o flash é rei, além de possuir suporte nativo a quase todos os formatos de imagem padrão, ainda consegue edita-las e com recuso á versão 10.x guarda-las no sistema operativo do utilizador nativamente. O silverlight suporta png e jpg nativamente, outros formatos também são suportados mas limitadamente.
10. Ligações via socket; Permite com que seja possivel uma ligação directa a um computador por via do seu IP; Neste ponto o flash ainda necessita de muitos melhoramentos e o suporte é muito pouco. O Silverlight consegue nativamente efectuar estas ligações.
11. Webcam e Micro; Suporte completo por parte do flash de uma maneira bem simples. O silverlight não suporta webcam nem microfone, embora esteja previsto para a próxima versão (3).
12. Distribuição final; O flash consegue apenas exportar um unico arquivo .swf e se necessário usar arquivos separados para imagens e ficheiros de configuração. O silverlight é mais complexo na sua exportação, o que produz bastantes ficheiros visto que é exportado separadamente, audio, video e imagens.
13. Aplicação Desktop; O flash pode ser exportado/arquivado como .exe, tornando por exemplo transformar um video flash em executavel windows. Pode ainda usar o AIR, adobe Integrated Runtime que permite a exportação de um qualquer projecto web para correr no desktop, permitindo a aplicação que se comporte como uma aplicação do sistema Operativo e tenha os mesmo privilégios, incluindo a criação e utilização de ficheiros locais para armazenar informação/dados. O silverlight não permite nada disto (embora na próxima versão esteja prevista esta capacidade por parte do silverlight).
14. Streaming / difusão; Apesar de suportar streaming, o flash necessita de um investimento extra, quer em programação quer no FMS (Flash media server) o que torna o seu suporte muito baixo. Por sua vez o Silverlight pode usar a plataforma Microsoft Silverlight Streaming, que permite gratuitamente guardar e fazer o stream dos seus arquivos media.
15. Suporte; O flash player encontra-se disponivel na maioria dos computadores, e conta com bastantes anos de experiencia e maturidade, enquanto o silverlight têm uma fraca taxa de penetração e tenha aparecido à pouco tempo. Mas esta taxa do silverlight pode facilmente ser superada, visto que se espera que as proximas versões/ actualizações dos seus sistemas operativos tragam o silverlight. A nivel de suporte por parte da comunida, é claro que uma tecnologia aberta como o AS3 possui uma muito maior comunidade, sendo extensa a lista de componentes e códigos fonte gratuitos. O silverlight como formato proprietario apenas começa agora a obter alguma atenção por parte da comunidade.

Embora o silverlight tenha, sem duvida, sido a melhor aposta da microsoft nos ultimos anos, deve demorar tempo para consguir roubar algum mercado ao adobe, embora esta listagem em cima demonstre que tanto o flash como o silverlight têm pontos fortes e fracos. Mas bom, por final o autor demonstra o quadro onde podemos ver alguns pontos interessantes desta comparação: 

Se bem que em alguns pontos não concorde com as opiniões expressas, acho que o artigo merece uma leitura completa e atenta, por isso vejam o post original aqui.

Espero que seja util na hora de optarem por desenvolver uma Ria.

Abraço.